和父亲孙中山一样，孙科一生中有过三段爱情，不同的是他始终和原配妻子陈淑英维持着婚姻关系。

1932年前后，孙科在上海通过杜月笙认识了年轻的教师严蔼娟，两人的关系一直断断续续，前后大概同居了4年。

1936年二人的女儿孙穗芳出生，但是在此之前，孙科已经认识了上海社交圈的名流蓝妮，并迅速陷入热恋，蓝妮也成为他公开的二夫人。

容貌秀丽的蓝妮是云南哈尼族苗王后代，1935年在上海的一次宴会上，孙科与蓝妮一见钟情，旋即邀请她担任自己的机要秘书，两人感情也与日俱增。

在公开娶蓝妮为妻后，为了表示自己的爱意，孙科曾经亲笔给蓝妮写过一张字据:“我只有元配夫人陈氏与二夫人蓝氏二位太太，此外决无第三人，特此立证，交蓝巽宜二太太收执。”

1938年，蓝妮在上海生下了女儿，名为孙穗芬。

1948年，在孙科与李宗仁争夺副总统之位时，本来被公认有蒋介石为后台，应当稳操胜券。然而此时《救国日报》头版头条刊篇报道，称抗战胜利后，国民党的中央信托局没收了蓝妮的一批德国进口的颜料，作为敌伪财产处理。

可是孙科致函国民大会秘书长，说这批颜料为”敝眷”蓝妮所有，要求发还。这个事件大大影响了孙科的声誉，一定程度上也造成了孙科的落选。

落选的结果也使得孙科与蓝妮最后分手，因为面对《救国日报》所做的大肆诋毁，孙科不仅未替蓝妮公开辩解，反而努力撇清自己，这让生性倔强的蓝妮大为失望，二人也就此形同路人。

1950年大概是孙科人生中最为沮丧的一年，除了权力与光环的远离，其家庭生活也频繁出现危机。13岁的孙穗芳跟随母亲严蔼娟前往香港来到孙家，原配陈淑英居然和严蔼娟在家中厮打起来。

虽然孙穗芳当时只有13岁，却一生都记得孙家的儿媳妇用孙科的手杖钩自己母亲的腿，而自己则一把抓住她头发的情形。为了表示自己的愤怒不满，倔强的孙穗芳举起孙家的一个古董花瓶，声称谁敢碰她，就把花瓶扔出去。

出门之后，孙穗芳还在停在门外的汽车中，整整按了两个小时的喇叭。

因为在儿女赡养问题上存在分歧，严蔼娟决定控告孙科遗弃，这件官司轰动了当时的香港社会。

为了增加在法庭上的把握，孙科甚至向已经分手的蓝妮，借当年严蔼娟收到女儿抚养费后出具的收据，因为这笔在名义上该由孙科支付的抚养费，实际上是由蓝妮承担。

蓝妮和孙科的女儿孙穗芬曾经说过，当年负责这件案件的律师把收据交还给蓝妮的时候曾经感慨:“你是唯一一个我认识的年轻漂亮的女人养老头子的。”

这句话的意思大概是，外界虽然曾传说孙科给蓝妮巨款买地皮建別墅，让人难堪的事实却是像孙穗芬所说的那样:“我爹爹没钱，还向我妈咪要钱呢。有时我妈咪回家，佣人告诉她，刚才老太爷来过了，放在外面的钱他拿走了。”

从这个意义上来说，孙科无法与父亲相比，即使与蓝妮热恋的时候，孙科也从来没有表现过与原配陈淑英离婚的意图，而强硬的陈淑英无论如何不肯让蓝妮进门。因此在夫人陈淑英暂时离开南京，前往上海的时候，孙科才会与蓝妮幽会。而一旦陈淑英有电话回来，孙科还会立刻回家听电话。

孙穗芳是孙科的6个孩子之一，也是所有的孙辈中和孙中山相貌最相近的一个。作为孙科的私生女，孙穗芳曾经非常心酸地回忆，小时候她和母亲严蔼娟住在上海，每天上学时总要经过一家眼镜公司，上面的广告是孙科的照片。每次经过的时候孙穗芳都要想，哦，这个是我的父亲。

1965年刚刚抵达台湾的孙科，再次见到了孙穗芳，此时孙科已经75岁，满头白发，垂垂老也。孙穗芳忍不住问父亲:“你为什么不要我?”

孙科对此的回答是:“从来也没有不要你。”虽然在30年骨肉分离的事实面前，这样的回答显得太过苍白，但是当孙科吻孙穗芳的面频时，孙穗芳依然泣不成声。

从那个时候开始，孙穗芳每年都会回到台湾两次看望父亲，直到1973年孙科病逝。但即使这个时候，孙穗芳在孙家依然没有得到认可，陈淑英并不愿意这对父女相见。

孙科甚至会为此使用一些小手段，比如当陈淑英去医院检查身体的时候，如果医院要求她多住一个星期，那大概就是孙穗芳要在台湾多待一个星期了。

1972年的时候，孙科曾经谈起22年前在香港那次激烈父女见面，孙科问:“拿了大花瓶要扔的是你吗?”孙穗芳没有回答。

孙科继续问:“在门外按了两个小时汽车喇叭的是你吗?”

孙穗芳反问：“那放狗把我赶出去的是你吗?”

上一代的恩怨已经无法解开，严蔼娟始终跟孙穗芳说:“你有没有看到这个大妈妈，脸上都是横肉。”孙穗芳也始终不能忘记陈淑英穿着偻空的皮鞋踢自己母亲头的画面。

1973年孙科离世后，当年水火不容的三个人如今已经统统不在人世，孙穗芳每年都会特意回到台湾给父亲和大妈妈陈淑英上坟，并在坟前请求陈淑英的谅解。