1949年新中国成立，为了投身于祖国的教育事业，1950年春她放弃了还有几个月就能获得的博士学位、优越的工作条件和生活环境。几经周折，转辗万里，回到了祖国。轮船到达青岛时，要升起中国国旗进港，船上一名外国水手翘起大拇指对她说;现在中国了不起了。

　　一回到上海，她就到市教育局要求马上安排工作。她很快被任命继续任中西女中校长。两年后，中西女中和圣玛利亚女中合并，成立市三女中，她担任副校长，问她对此有什么想法，她说，只要有利于教育事业的发展，都可以。

　　1960年薛正被任命为市三女中校长，除了建立一支精通业务，教风严谨，热爱学生的师资队伍，在外语教学方面保持固有的特色，她更加注意全面培养提高学生的素质。她常到大食堂和学生一起进餐，了解学生的伙食状况，要学生注意营养。她漫步在走廊里，草坪上，带头拾废纸、拔杂草，她要求学生做的事，自己先做。新生入校不久，她往往就能叫得出名字。她为人正直，敢于直言不讳。学校里那片被日寇破坏过的草坪，解放后更加平整美观，一直是学生憩息和举办各种活动的好地方。1958年大跃进的时候，学校要养猪种菜，有人主张把大草坪挖掉种菜，薛校长坚决不同意。有人说薛正不关心人，只关心草地。这话被薛校长知道了，她说，我正是从关心学生出发，才不让毁掉这块草坪，没有大草坪，灰沙多了，就影响学生的生活学习环境。

　　1972年薛校长重返教育岗位，这时她已是71岁的老人，她以加倍的努力投入工作。上海市三女中的外语教学一直是领先的，“文革”中被严重削弱了。为恢复市三女中外语教学的优势，薛校长又着重抓外语教学，十多年一直坚持听课，参加外语教研活动，和老师一起研究，还曾从香港请一名老师教外语。她的努力取得了优异成果，市三女中的外语教学一直居干全市乃至全国的前茅。市三女中的校园、校舍一直是整洁美观，令人羡慕的。“文革”中被破坏了。薛校长又负责校园、校舍的修整恢复。争取海外一些校友的支持帮助。例如健身房的整修得到了在香港的1946级校友蔡咏芳等资助。

　　“文革”期间市三女中改名为三中，兼收男生。薛正校长是从事女子教育的专家，她对女子教育有独到的见地。她认为男女在智力上各有长短，而男女在生理上的区别是明显的，女子教育应当同男生有所区别。对于笼统地讲“男女都一样”的说法，她一直认为是不科学的。她认为男女生的文化科学知识教育应当相同，除此以外，特别要强调女性的道德教育和必需的家政教育，教育女子如何做好一个新时代的女性。除了在业务上发挥作用外，一个女性的道德素养如何，将影响丈夫、孩子及整个家庭以至于整个社会。教育好了女性，会影响整个社会。从这个意义上讲，女性的作用大大超过了“半边天”的实际作用。薛正校长为恢复女中的建制作了宣传和理论准备。1981年市里决定学校仍改为上海市第三女子中学，并确定为部分寄宿制的上海市重点中学。此后，薛校长和其他校领导更加致力于探索女子教育规律，提供优异的成才环境，培养优良的女子人才。1984年10月上海市人民政府授予薛正为上海市第三女子中学终身名誉校长。