在重庆中美合作所渣滓洞监狱，黄绍辉被囚禁在男牢楼上五室。不久，敌人又先后三次对他进行审讯、拷打和用刑。黄绍辉仍坚持在万县和西南长官公署第二处的口供，不承认是共产党，更没有向敌人供认党的组织。由于黄绍辉多次遭受拷打、用刑，伤势严重，身子不能自行起卧、挪动。难友们见了，都热情地扶他起卧，给他喂食、洗伤。在难友们的关心、照护下，黄绍辉的伤势有所好转，身体渐渐康复。他主动向难友们介绍有关经济工作特别是农村合作基金的情况。不久他被难友们选为室长。黄绍辉热情地担负起了这牢房室长担子。难友们有什么心里话，都愿向他说；有什么难事，都要求他帮助设法解决；牢室里出了什么事被特务、看守们发现，也都要拿他是问。黄坚持为室里扫地、倒马桶，为难友们洗衣服、缝补破烂。隆冬时节到了，难友曹作康衣衫单薄着凉生病，黄和其他难友热情为其熬药。黄绍辉还从棉被里抽出棉絮，从袜子毯子里抽出线来，给曹作康缝了一件棉背心，使曹渡过严寒。

 　　1949年元旦，渣滓洞监狱的党组织为了迎接新中国的成立和庆贺人民解放战争的胜利，鼓舞全体难友的革命斗志，决定组织全监狱的难友召开新春联欢会。经过努力争取和斗争，终于获得监狱的准许。那天，囚禁在渣滓洞监狱的全体难友，走出牢房，载歌载舞，召开新春联欢会，不少牢室和难友，还利用这一机会互送贺年片和礼物，以表庆贺、祝愿和鼓励。黄绍辉所在牢室的难友们，在自制的贺年片上画了一个五角星，并写了英文字母“V”，送给其它牢室的难友。谁知这张贺年片被监狱看守发现了，看守当即追到男牢五室，问是谁画的？难友们不答话。看守举鞭欲打挨近的一位难友，黄绍辉见状，立即说：“不准打，是我画的！”看守放下鞭子，走到黄绍辉面前，恶狠狠地说：“好嘛，你承认了，就打你。”看守当众打了黄绍辉十个手心，并罚全室禁闭半个月，不准放风出门。

 　　1949年夏天，男牢楼六室的一位难友打米时，在敌看守室里发现有一张伪《中央日报》，悄悄将其带回牢室阅看，不料被看守查房时发现了。看守长徐贵林怒冲冲地到楼六室追查是谁拿来的，查不出人来，他便宣布停止楼六室的放风，不准给送水喝。黄绍辉和楼五室的难友们知道了这一情况，见楼六室的难友们暑天被囚禁口渴难忍，决定利用放风的机会，为他们送水喝。为了遮挡视线，黄绍辉和全室的难友多洗些衣服晾在走廊的栏杆上，在衣服的遮挡下，坚持每天放风的时候给楼六室的难友们送水。谁知有一天送水时，突然一阵大风吹来，卷起了遮挡的衣服。看守长徐贵林从卷起的衣服缝隙中，发现了唐慕陶送水的身影，随即冲上楼去，抓住唐慕陶问是谁的主意？唐慕陶不答话，徐举鞭要打。黄绍辉见了，从牢房里挺身而出：“不准打人，是我的主意！”徐见又是黄绍辉，咬牙切齿地说：“黄绍辉你好大的胆！竟敢破坏监狱规定！”黄理直气壮地说：“这么热的天，不给人水喝，凭什么？”徐蛮横地说：“这里不是讲理的地方！”黄回应了句：“简直没有一点人道！”徐恼羞成怒地举鞭向黄绍辉打去。全室的难友见状，都举起拳头怒吼：“不许打人！”全监狱的难友听见吼声，都伸出头来举手高呼：“不许打人！不许打人！”在难友们的怒吼声中，徐贵林只得灰溜溜地缩进了看守所。

 　　1949年10月1日，中华人民共和国胜利诞生了。中国人民解放军开始向大西南乘胜挺进。国民党反动派在中国大陆的反动统治即将最后崩溃，11月27日，白公馆和渣滓洞监狱关押的共产党人和革命志士被一批批押出监牢秘密杀害。深夜，国民党反动军警觉得来不及了，干脆将渣滓洞监狱剩下的难友集中在楼下八间牢房里，上了锁，架起机关枪卡宾枪扫射，然后又打开牢门逐个检查补射，最后又架上木柴浇上汽油，将牢房尸首一同烧掉。在补枪时左眼中弹的黄绍辉使出最后的力气，向牢门爬去，不幸昏迷，被罪恶的烈火和浓烟吞噬了生命。