转移

　　等努力以农业生产合作社试点的合法手段开展党的农运工作的时候，中共涪陵五县工委遭到了敌特的破坏。为防不测，上级对长寿的地下党组织进行转移、疏散。黄绍辉被调往川北隐蔽。他先后隐蔽于阆中、大竹、营山等地合作金库。 　　1943年初，党组织根据黄绍辉长期从事经济工作并有丰富的经济工作和地下工作的经验，将他安排到由南方局直接领导的中国工业原料公司工作，直至1945年秋，公司随中共中央南方局迁往华东。

 　　1947年春，中共四川省委和《新华日报》被迫撤离重庆，将原经办的经济组织“工程行”移交给重庆地下党办理。重庆地下党组织接管“工程行”后，改名为“裕中行”，专营汽车运输业务，安排黄绍辉担任“裕中行”经理。

 　　这年秋季的一天，黄绍辉随“裕中行”的一辆货运卡车路经成都，被国民党军队以“剿共需要”为名强行抢劫。黄绍辉回重庆向组织汇报后，党组织即对“裕中行”的人员作了妥善安排，将黄绍辉安排去万县筹建炼油厂，并担任经理。随同去万县的还有“裕中行”的徐勋和黄绍辉的新婚妻子地下党员樊汝琴。

 　　黄绍辉来到万县着手筹建炼油厂，与万县地下党组织接上关系，并与原已相识的中共川东临委副书记兼下川东地委书记涂孝文相见。黄绍辉因筹建炼油厂的需要，先在一公路边找到一个店铺，以做生意为掩护，开展活动。涂孝文是这里的常客。

被捕

　　1948年4月，重庆地下党发生了《挺进报》事件，党组织遭受到严重破坏，市委书记刘国定和副书记冉益智先后被捕叛变，向敌人供出了一大批地下党人的名单，其中有涂孝文。国民党西南长官公署二处处长徐远举得知此线索，立即派二处特务雷天云、左志良，由冉益智带路，赶往万县捕捉涂孝文。

 　　1948年6月11日（端午节）中午，黄绍辉和涂孝文相约一起到杨家街口的长江岸边看划龙船，不料前来捕捉涂孝文的国民党特务躲藏在看划龙船的人丛中。突然，冉益智发现了人丛中的涂孝文，立即告诉雷天云和左志良，冉益智叫了一声“涂孝文”，涂孝文立即回过头来观望。不料，两只手枪对准了他的胸膛。一旁的黄绍辉来不及躲藏和逃走，也同时被国民党特务逮捕。

刑讯

　　黄绍辉和涂孝文被捕后，立即被带到他们在万县的住地复源旅社，进行审讯。在敌人的严刑拷打和多方利诱下，涂孝文背叛革命，供出了川东地下党组织和黄绍辉在公路边经营的店铺，称黄绍辉“同情革命”。于是，雷天云和左志良一面派人搜查此店铺，一面加紧对黄绍辉审讯。雷、左再三追问黄绍辉是干什么的，黄始终咬定是做生意的。任凭他们用皮鞭抽打、拷问，黄绍辉坚持不改口。

 　　第二天，雷、左将头天被皮鞭打得遍体鳞伤的黄绍辉用绳子捆在老虎凳上用刑，黄绍辉痛得死去活来，忍着剧痛回答：“我是个商人，没有什么组织交待！”

 　　硬的不行，便来软的，他俩将涂孝文带进屋来，要涂孝文劝说黄招供。涂孝文见黄绍辉坐在老虎凳上，便说：“老黄，你……”黄绍辉料到涂已叛变，怒不可遏地大骂道：“涂孝文，你这个没良心的东西！你在我这里入股做生意，吃我用我，还要咬我是共产党！”涂孝文被骂得低下了头，不敢继续说下去，只得退了出去。

 　　敌人无计可施，只得用船将黄绍辉迅速押往重庆西南长官公署第二处。

 　　在重庆西南长官公署第二处，黄绍辉又遭受敌人审讯，要他承认是共产党，要他写《自白书》。黄绍辉面对敌人的审讯、拷问，仍坚持自己是做生意的，不是共产党，拒绝写《自白书》。敌人无可奈何，最后将黄绍辉押往重庆中美合作所渣滓洞监狱囚禁。